16020 16030 16040 16050 16060 16070 16080 16090 16100 16110 16120 16130 16140 16150 16160 16170 16180 16190 16200 16210 16220 16230 16240 16250 16260 16270 16280 16290 16300 16310 16320 16330 16340 16350 16360 16370 16380 16390 16400 0123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890123 4567890123 45678901234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890123 456789012345678901234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901 tctgttctttcatggggaagcaaattt?ggtaccacccaagtattggctcacccatcaacaaccgctatgtatttcgtacattactgccagccaccatgaatattgtacagtaccataatcacttaaccacctatagtacataaaaacccactc cacatcaaaa ccccccccccatgcttacaagcacgcacaacaatcaacccccaactgtcgaacataaaccacaactccaaagacacccct cccccaccccgataccaacaaacctacccaccctt?acagtacatagtacataaaaccatataccgtacatagcacattacagtcaaatccctcctcgcccccacggatgccccccctcagataggaatcccttgatc ---------------------------aa--------t-----------t-tt---t- -------------------------------------------------------t---------c---t-------a-----c---c-- --c- -----t-c-- --t--a---t------------------------------t--------ac-------a-----------------t---- -------------------------ta-t-t---a-----------------c----g--c---a-------------------------a-----------------------------------g--------c- ; chimpanzee, derived. ---------------------------aa--g-------------------tt--ct- t---------------------------------------------ac-t-----t-------t-------------ac-----------t--atc-----t---- -tt---------------------a----t--------t-----------------ca------c----------t--- -------------------------ga-a-t----a-----------c-----c--tt---------------------------------a-------------------------------------------gc-; bonobo, derived ----------------------g----g------------------a--------------------------------------------------------------g---------at----g-------g-----------------a-- ---------- -----t-----------------a-t---g---------tt-----a--ac----c---tg-----------c------- -a-----tag----t--------------------a-------------------g----t--------------------------------t----t-----t-----a---------------gg--------c- ; modern humans, derived --------------g----g----g------------------a-----------g-------------------------------------------------------------t----g--t----gc--------------t-a-- --------cc -----------------------a-----g---------tt--------at----c---t--------------g---t-a-a-----tag----t--------------------g-----------c-------gt---t--------------------------------t----------t-----a---- ; AF282971, Croatia Neanderthal: the G3 layer in Vindija Cave ----------a-------------------c-----------------------------------------------------t----g--t----g--a------------t-a-- --------cc -----------------------a-----g---------tt--------at----c---t------------------t-a-a-----tag----t--------------------g-----------c-------gt---t-------------------t------------t----------t-----a---------------gg-------- ; AF254446, Russia Neanderthal: Southern Russia, Mezmaiskaya Cave --------------g----g----g------------------a-----------g--------------c-------------tt--tt---------------------------t----g--t----gc--------------t-a-- ---------c -----------------------a-----g---------tt--------at----c---t--------------g---t-a-a-----tag----t--------------------g-----------c-------gt---t--------------------------------t----------t-----a---------------gg--------- ; AF011222, Feldhofer Neanderthal ---------------------------aa--g-------------------tt--ct- t---------------------------------------------ac-t-----t-------t-------------ac-----------t--atc-----t---- --------------a--t-------a----t----g---t------------------ ---cc-c----------t--c -------------------------ga-agt----a-----------c-----c--tt---------------------------------a-------------------------------------------gc- ; D38116, Pan paniscus mitochondrial DNA, complete sequence. --g-------------------tt--ct- t---------------------------------------------ac-t-----t-------t-------------ac-----------t--gtc-----tg--- -tt---------------------a---ct-ca-----tt--c-------------ca------c----------t--- --t----------------------ga-a-t----a-t---------c-----c--tt-----t--c------------------------a------t-----------a----- ; AF451969, Pan paniscus Marilyn mitochondrial D-loop, partial sequence. ---t----aa--g-------------------tt--ct- t---------------------------------------------ac-t-----t-------t-------------ac-----------t--gtc-----tg--- -tt---------------------a----t--c-----tt----------------ca------c----------t--- --t----------------------ga-a-t----a-t---------c-----c--tt-----t--c------------------------a------t-----------a---------------- ; AF451967, Pan paniscus Louise mitochondrial D-loop, partial sequence. --g-------------------tt--ct- t---------------------------------------------ac-t-----t-------t-------------ac--------g--t--atc-----t---- --t---------------------a----t----g---t-----------------ca------c----------t--- -t-----------------------gg-a-t----a-----------c-----c--tt---------------------------------a---------------------------------- ; AF176764, Pan paniscus isolate TOBY mitochondrial D-loop, partial sequence. --g-------------------tt--ct- t---------------------------------------------a--t-----t---------------------ac-----------t--atc-----t---- -ttta-------------------a----t--------t---------a-------ca-----------------t--- --------------t----------ga-a-t----g-t---------------c-gt----------------------------------a-t-------------------------------- ; AF176763, Pan paniscus isolate VERNON mitochondrial D-loop, partial sequence. --g---------c---------tt--ct- t---------------------------------------------a--t-----t-c-----t-------------ac-----------t-tatc-----t---g --tt---t----------------a----t--------t-----------------cag-----c----------t--- -------------------------gaaa------g-t--------a------c--t----------------------------------g---------------------------------- ; AF176762, Pan paniscus isolate SUSIE mitochondrial D-loop, partial sequence. --g-------------------tt--ct- t-------------------------------t-------------a--t------------------t--------ac-----------t--att-----t---- -ttta-----------------t-a----t--------t---------a-------ca--------------------- --------------t----------ga-a-t----g-t---------------c--tt---------------------------------a-t----t--------------------------- ; AF176761, Pan paniscus isolate MATATA mitochondrial D-loop, partial sequence. --g-------------------tt--ct- t---------------------------------------------ac-t-----t-------t-------------ac-----------t--atc-----t---- -tt---------------------a----t----g---t-----------------ca------c----------t--- -------------------------ga-agt----a-----------c-----c--tt---------------------------------a---------------------------------- ; AF176760, Pan paniscus isolate MARINGA mitochondrial D-loop, partial --g-------------------tt--ct- t---------------------------------------------a--t-----t---------------------ac-----------t--atc-----t---- -ttta-------------------a----t--------t---------a-------ca-----------------t--- --------------t----------ga-a-t----g-t---------------c-gt----------------------------------a-t-------------------------------- ; AF176759, Pan paniscus isolate MAIKO mitochondrial D-loop, partial sequence. --g-------------------tt--ct- t---------------------------------------------a--t-----t---------------------ac-----------t--atc-----t---- -ttta-------------------a----t--------t---------a-------ca--------------------- --------------t----------ga-a-t---cg-t---------------c-gt-------t--------------------------a-t-------------------------------- ; AF176758, Pan paniscus isolate LODY mitochondrial D-loop, partial sequence. --g-------------------tt--ct- t---------------------------------------------ac-t-----t-------t-------------ac-----------t--gtc-----tg--- -tt---------------------a----t--c-----tt----------------ca------c----------t--- --t----------------------ga-a-t----a-t---------c-----c--tt-----t--c------------------------a------t-----------a--------------- ; AF176757, Pan paniscus isolate LINDA mitochondrial D-loop, partial sequence. --g-------------------tt--ct- t---------------------------------------------ac-t-----t-------t-------------ac-----------t--atc-----t---- -tt-------------------t-a----t--------t-----------------ca-----------------t--- -------------------------ga-ag-----a-----------c-----c--tt--------------------------------ta------t--------------------------- ; AF176756, Pan paniscus isolate KITTY mitochondrial D-loop, partial sequence. --g-------------------tt--ct- t---------------------------------------------ac-t-----t-------t-------------ac-----------t--atc-----t---- -tt---------------------a----t----g---t-----------------ca------c----------t--- -------------------------ga-agt----a-----------c-----c--tt---------------------------------a---------------------------------- ; AF176755, Pan paniscus isolate KIDONGO mitochondrial D-loop, partial --g-------------------tt--ct- t---------------------------------------------ac-t-----t-------t-------------ac-----------t--atc-----t---- -tt---------------------a----t----g---t-----------------ca------c----------t--- -------------------------ga-agt----a-----------c-----c--tt---------------------------------a---------------------------------- ; AF176754, Pan paniscus isolate KAKOWET mitochondrial D-loop, partial --g-------------------tt--ct- t---------------------------------------------a--t-----t---------------------ac-----------t--atc-----t---- -ttta-------------------a----t--------t---------a-------ca-----------------t--- --------------t----------ga-a-t----g-t---------------c-gt----c-----------------------------a-t--t----------------------------- ; AF176753, Pan paniscus isolate JOEY mitochondrial D-loop, partial sequence. --g-------------------tt--ct- t---------------------------------------------ac-t-----t-------t-------------ac-----------t-tatc-----t---- -tt---------------------a----t--c-g---t-----------------ca------c----------t--- -------t-----------------ga-agtt---a-----------------c--tt---------------------------------a---------------------------------- ; AF176752, Pan paniscus isolate JIMMY mitochondrial D-loop, partial sequence. --g-------------------tt--ct- ----------------------------------------------ac-t-----t-------t-------------ac-----------t--atc-----t---- -tt---------------------a----t----g---t-----------------cg------c----------t--- -t-----------------------ga-agt----a-----------c-----c--tt---------------------------------a---------------------------------- ; AF176751, Pan paniscus isolate DIATOU mitochondrial D-loop, partial sequence. --g-------------------tt--ct- t---------------------------------------------a--t-----t---------------------ac-----------t--atc-----t---- -ttta-------------------a----t--------t---------a-------ca-----------------t--- --------------t----------ga-a-t----g-t---------------c-gt----------------------------------a-t-------------------------------- ; AF176750, Pan paniscus isolate CONGO mitochondrial D-loop, partial sequence. --g-------------------tt--ct- t---------------------------------------------ac-t-----t-------t-------------ac-----------t--atc-----t---- -tt---------------------a----t----g---t-----------------ca------c----------t--- -------------------------ga-agt----a-----------c-----c--tt---------------------------------a---------------------------------- ; AF176749, Pan paniscus isolate CHARLIE mitochondrial D-loop, partial --g-------------------tt--ct- t---------------------------------------------a--t-----t---------------------ac-----------t--atc-----t---- -ttta-------------------a----t--------t---------a-------ca-----------------t--- --------------t----------ga-a-t----g-t---------------c-gt----------------------------------a-t-------------------------------- ; AF176748, Pan paniscus isolate BOSONDJO mitochondrial D-loop, partial